به دلیل شیوع ویروس کرونا از ۲۴ اسفند ماه ۹۸ فعالیت مترو اصفهان متوقف شد. پس از این مدت امروز سه شنبه ۱۳ خرداد ۹۹، در راستای رفاه و سهولت شهروندان، فعالیت خط یک مترو اصفهان با رعایت پروتکل‌های بهداشتی از جمله الزام استفاده از ماسک از سوی مسافران مترو از سر گرفته شد. جابجایی شهروندان از طریق مترو از ساعت ۶:۱۵ صبح تا ۲۱:۳۰ است، سرفاصله زمانی فعلاً ۱۵ دقیقه خواهد بود و در صورت رعایت کامل پروتکل‌های بهداشتی توسط همشهریان و افزایش تقاضا، این فاصله در روزهای بعد به همان ۱۱ دقیقه باز خواهد گشت.