به گزارش ایسنا، آیا مغز حفظ شده آلبرت اینشتین، که به ۲۴۰ واحد تقسیم و از زمان مرگ او در سال ۱۹۵۵ نگهداری شده است، میتواند سرنخهایی درباره پایههای سلولی نبوغ ارائه دهد؟ آیا بافتهای سرطانی منجمد شده و ذخیره شده در آرشیو بیمارستانها به مدت نزدیک به یک دهه، اکنون میتوانند اسرار تکامل تومور را فاش کنند؟ دانشمندان چینی میگویند روش پیشرفته نقشهبرداری آرانای آنها ممکن است روزی مطالعه چنین نمونههایی را امکانپذیر کند.
به نقل از آیای، گروهی از BGI-Research و مؤسسات شریک آن، ابزار Stereo-seq V۲ را توسعه دادهاند که یک ابزار پیشرفته ترنسکریپتومیکس مکانی است که میتواند نمونههای زیستی قدیمی که زمانی غیرقابلاستفاده محسوب میشدند را تحلیل کند. این روش با موفقیت بافتهای سرطانی که نزدیک به یک دهه تحت شرایط نامطلوب نگهداری شده بودند را پردازش کرد و امیدها را برای استخراج درک علمی از نمونههای حفظ شده برای مدتی طولانی را افزایش داد.
اگر آنقدر خوششانس باشیم که بتوانیم مغز اینشتین را بررسی کنیم، میتوانیم امتحانش کنیم. اما چالشها قابلتوجه است، زیرا روشهای نگهداری در آن زمان ممکن است خیلی مناسب نبوده باشد. نمیتوان بهطور قطعی گفت.
مغز اینشتین با استفاده از روشهای میانه قرن بیستم حفظ شد، مدتها قبل از پیشرفتهای ذخیرهسازی ژنتیکی، که قابلیت استفاده آن را نامطمئن میسازد.
با این حال، پیشرفت Stereo-seq V۲ گامی بزرگ به سمت باز کردن اطلاعات ارزشمند از آرشیوهای قدیمی بالینی را نشان میدهد.
نمونههای زیستی سنتی در واحدهای پارافین-ثابتشده با فرمالین (FFPE) نگهداری میشوند که روشی مقرونبهصرفه و پایدار برای دههها بوده است. اما اغلب از نظر شیمیایی آسیب دیدهاند. این تخریب، تحلیل دیانای و آرانای را که موضوعی حیاتی است محدود میکرد زیرا دیانای اطلاعات ژنتیکی را ذخیره میکند و آرانای آن را به پروتئینها تبدیل میکند.
Stereo-seq V۲ این موانع را با بهبود کارایی جذب آرانای و استفاده از شیمی پایهگیری تصادفی برای پوشش کامل ژن حتی در نمونههای تخریبشده برطرف میکند.
در آزمایشها، این ابزار آرانای را با وضوح تکسلولی نقشهبرداری کرد و زیرنوعهای تومور و پاسخهای ایمنی را در بافتهای سرطانی قدیمی شناسایی کرد.
لیائو شا، مدیر ارشد فناوری STOmics و نویسنده مشترک این مطالعه، میگوید: تیم نمونهها را قبل از استفاده به دقت بررسی میکند: اگر نمونهها خیلی تخریب شده باشند، نمیتوانستیم آنها را بهطور مؤثر تحلیل کنیم.
بیمارستانهای سراسر جهان میلیونها نمونه را اغلب برای ۲۰ سال یا بیشتر نگه میدارند. تا پیش از این، بسیاری از اطلاعات ژنتیکی توسط آسیبهای ناشی از نگهداری خارج از دسترس مانده بودند. این روش جدید مجموعه نمونههای قابلتحقیق برای بیماریهای نادر را گسترش میدهد. بسیاری از بیماریهای نادر نیاز به زمان طولانی برای جمعآوری نمونهها دارند. اکنون میتوانیم بهطور مؤثر از نمونههای ارزشمند که طولانیمدت حفظ شدهاند استفاده کنیم.
پژوهشگران معتقدند این روش میتواند منجر به تشخیص زودهنگام، درمانهای شخصیسازیشدهتر برای سرطان و مطالعات گذشتهنگر روی نمونههای آرشیوی شود.
در حالی که چشمانداز رمزگشایی نبوغ اینشتین هنوز نامطمئن است، کاربردهای واقعی این روش فوری هستند و ابزارهای دقیقتری برای کاوش زیستشناسی سرطان، عفونت و بیماریهای نادر ذخیرهشده در آرشیوهای بافتی به دانشمندان ارائه میدهند.
انتهای پیام
نظرات