پس از اعلام شیوع ویروس کرونا در کشور از سوی وزارت بهداشت بیمارستان های خورشید و عیسی بن مریم(ع) اصفهان در لیست بیمارستان‌های مرجع رسیدگی به این بیماری قرار گرفتند و به حالت آماده‌باش درآمدند. اکنون بیمارستان خورشید به عنوان یکی از دو بیمارستان تخصصی عفونی، خط مقدم مبارزه با کرونا در اصفهان است.